JavaScript でデバッグ出力 (trace) を使用
ASP.NET Ajax を使用していると、 JavaScript で trace() が利用できます。デフォルトの出力先は、 Visual Studio の出力ウィンドウです。これで、表示がうっとうしい alert() に頼らずにすみます。
Sys.Debug.trace("debug");
なお、デバッグ出力を行うには、 Internet Explorer の詳細設定で「スクリプトのデバッグを使用しない」のチェックを外す必要があります。